Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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FOXD4Q12950 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FOXD4Q12950 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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