Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 SPC72YAL047C 1869 nt1.65□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 HSL1YKL101W 4557 nt1.64□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YDR286CYDR286C 345 nt1.64□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YLR458WYLR458W 381 nt1.64□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 TAP42YMR028W 1101 nt1.64□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YNL235CYNL235C 432 nt1.64□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 FYV12YOR183W 390 nt1.64□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YBR287WYBR287W 1284 nt1.64□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 PKH3YDR466W 2697 nt1.64□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 SOK2YMR016C 2358 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 RPL40AYIL148W 387 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 IST3YIR005W 447 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YLR031WYLR031W 561 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YPT6YLR262C 648 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 CCW14YLR390W-A 717 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YPL238CYPL238C 390 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 TAZ1YPR140W 1146 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 POP7YBR167C 423 nt1.63□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 SAC3YDR159W 3906 nt1.62□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 SBE22YHR103W 2559 nt1.62□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 SHE4YOR035C 2370 nt1.62□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YDL009CYDL009C 324 nt1.62□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YJL119CYJL119C 324 nt1.62□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 CSE4YKL049C 690 nt1.62□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 ATP18YML081C-A 180 nt1.62□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 CRM1YGR218W 3255 nt1.62□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 CRD1YDL142C 852 nt1.61□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YDR537CYDR537C 606 nt1.61□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 IPP1YBR011C 864 nt1.61□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 SAR1YPL218W 573 nt1.61□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 STB4YMR019W 2850 nt1.61□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 FAB1YFR019W 6837 nt1.61□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 RPH1YER169W 2391 nt1.61□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YOR093CYOR093C 4947 nt1.6□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YDL062WYDL062W 426 nt1.6□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 PGD1YGL025C 1194 nt1.6□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 ACF4YJR083C 930 nt1.6□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt1.6□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YNL226WYNL226W 411 nt1.6□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.6□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 ATP15YPL271W 189 nt1.6□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YJR039WYJR039W 3366 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 LHS1YKL073W 2646 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 snR5snR5 204 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 IRC2YDR112W 309 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 RPL29YFR032C-A 180 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YGL109WYGL109W 324 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 TAD1YGL243W 1203 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 SMD1YGR074W 441 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 DFG10YIL049W 762 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 PEP8YJL053W 1140 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YNL150WYNL150W 408 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YPR170CYPR170C 336 nt1.59□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 MSH6YDR097C 3729 nt1.59□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 TFC8YPL007C 1767 nt1.59□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 BRO1YPL084W 2535 nt1.59□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 VPS35YJL154C 2835 nt1.58□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 SPO22YIL073C 2928 nt1.58□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 APM3YBR288C 1452 nt1.58□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 FAR7YFR008W 666 nt1.58□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YBR063CYBR063C 1215 nt1.58□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 MON2YNL297C 4911 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 CFT1YDR301W 4074 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 PAU3YCR104W 375 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 BMT5YIL096C 1011 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 SDS22YKL193C 1017 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 SYM1YLR251W 594 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 GRX5YPL059W 453 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YCL002CYCL002C 792 nt1.57□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 RRI2YOL117W 1938 nt1.56□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt1.56□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 GRX8YLR364W 330 nt1.56□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 MRPL44YMR225C 297 nt1.56□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YOR105WYOR105W 327 nt1.56□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 SEC63YOR254C 1992 nt1.56□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 TDA9YML081W 3756 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 PEX8YGR077C 1770 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 BTT1YDR252W 450 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 MZM1YDR493W 372 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 RPI1YIL119C 1224 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 RPC25YKL144C 639 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 ARV1YLR242C 966 nt1.55□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.54□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 HSK3YKL138C-A 210 nt1.54□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 COA6YMR244C-A 315 nt1.54□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.54□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 CYB5YNL111C 363 nt1.54□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 SPC110YDR356W 2835 nt1.54□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 snR83snR83 306 nt1.53□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.53□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 SPO11YHL022C 1197 nt1.53□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 TPM2YIL138C 486 nt1.53□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 BUD19YJL188C 309 nt1.53□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 YNL010WYNL010W 726 nt1.53□□□□□ -2.16
SNF8Q12483 RPS7BYNL096C 573 nt1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.1 ms