Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 ERP6YGL002W 651 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 YGL074CYGL074C 327 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 COA3YJL062W-A 258 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 snR191snR191 274 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 SNU114YKL173W 3027 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 SAP4YGL229C 2457 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 CIN1YOR349W 3045 nt3.68□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 NCL1YBL024W 2055 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 YPR003CYPR003C 2265 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 ULI1YFR026C 510 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 SNC2YOR327C 348 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 YPR014CYPR014C 330 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 RPS23BYPR132W 438 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 YCG1YDR325W 3108 nt3.67□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 FAS2YPL231W 5664 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 TRM2YKR056W 1920 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 SSS1YDR086C 243 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 RPL14AYKL006W 417 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 YLR012CYLR012C 300 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 TRX1YLR043C 312 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 MLH2YLR035C 2088 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 DPH6YLR143W 2058 nt3.66□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 CDC20YGL116W 1833 nt3.65□□□□□ -1.82
TY1A-DR3Q12441 YEL073CYEL073C 324 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YHR210CYHR210C 1026 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YOR318CYOR318C 306 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 SGF11YPL047W 300 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 IOC2YLR095C 2439 nt3.65□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 ABP140YOR239W 1887 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 BCK2YER167W 2556 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 GSC2YGR032W 5688 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 NUP133YKR082W 3474 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 APC11YDL008W 498 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YDR286CYDR286C 345 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YOL057WYOL057W 2136 nt3.64□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 SEC15YGL233W 2733 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 snR72snR72 98 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 QCR7YDR529C 384 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 COX23YHR116W 456 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 RPL20BYOR312C 519 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 TMA108YIL137C 2841 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 NSP1YJL041W 2472 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YBR184WYBR184W 1572 nt3.63□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 NCR1YPL006W 3513 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 MSR1YHR091C 1932 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 POG1YIL122W 1056 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YLR255CYLR255C 354 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 VPS54YDR027C 2670 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 COG3YER157W 2406 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 FOX2YKR009C 2703 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 SWH1YAR042W 3567 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 BRE4YDL231C 3378 nt3.62□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 MDM20YOL076W 2391 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YGL024WYGL024W 336 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YMR324CYMR324C 243 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 FPR1YNL135C 345 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 DOT6YER088C 2013 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 ALK2YBL009W 2031 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 KAR3YPR141C 2190 nt3.61□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 MTR10YOR160W 2919 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 INA22YIR024C 651 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 RSM19YNR037C 276 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 SPT21YMR179W 2277 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 JEN1YKL217W 1851 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 DUF1YOL087C 3351 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 OSH2YDL019C 3852 nt3.6□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 MTC4YBR255W 2085 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 YGL036WYGL036W 2730 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 EXO84YBR102C 2262 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 snR74snR74 88 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 FEX2YPL279C 1128 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 CCM1YGR150C 2595 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 BNI4YNL233W 2679 nt3.59□□□□□ -1.83
TY1A-DR3Q12441 HMG1YML075C 3165 nt3.59□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 TMN3YER113C 2121 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 YLR352WYLR352W 2424 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 MCM7YBR202W 2538 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 LSO2YGR169C-A 279 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 YHL005CYHL005C 393 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 RNR1YER070W 2667 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 MNN4YKL201C 3537 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 MUK1YPL070W 1839 nt3.58□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 SOK1YDR006C 2706 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 GIN4YDR507C 3429 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 PRP22YER013W 3438 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 YGL069CYGL069C 465 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 CFT2YLR115W 2580 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 RPO31YOR116C 4383 nt3.57□□□□□ -1.84
TY1A-DR3Q12441 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms