Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RASGEF1BQ0VAM2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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