Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD3Q0VAK6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD3Q0VAK6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD3Q0VAK6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms