Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 CBF2YGR140W 2871 nt2.67□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 PTC5YOR090C 1719 nt2.67□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 RGL1YPL066W 1440 nt2.67□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 NUP100YKL068W 2880 nt2.67□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 SEC16YPL085W 6588 nt2.66□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 UBP11YKR098C 2154 nt2.66□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 FMP16YDR070C 282 nt2.66□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 PBI2YNL015W 228 nt2.66□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 YDR239CYDR239C 2364 nt2.66□□□□□ -1.98
SSP2Q08646 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.65□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YKR051WYKR051W 1257 nt2.65□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 ATP19YOL077W-A 207 nt2.65□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 ACM1YPL267W 630 nt2.65□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YIL080WYIL080W 4722 nt2.65□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 TFC3YAL001C 3483 nt2.65□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 GYP5YPL249C 2685 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SMB1YER029C 591 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 BIG1YHR101C 1008 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 GPI15YNL038W 690 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 NOP15YNL110C 663 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YBR277CYBR277C 402 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SSD1YDR293C 3753 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 PSD2YGR170W 3417 nt2.64□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 MSL5YLR116W 1431 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 DAD4YDR320C-A 219 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YGR045CYGR045C 363 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 RPL40AYIL148W 387 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 MRPL44YMR225C 297 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YMR320WYMR320W 306 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 NCL1YBL024W 2055 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 PRK1YIL095W 2433 nt2.63□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 REV1YOR346W 2958 nt2.62□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 FYV7YLR068W 456 nt2.62□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.62□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 RRP6YOR001W 2202 nt2.62□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SPE1YKL184W 1401 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 RRP12YPL012W 3687 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YDL068WYDL068W 330 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YPS5YGL259W 498 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SYS1YJL004C 612 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YKL111CYKL111C 336 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 RMP1YLR145W 606 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 CTK3YML112W 891 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 PKR1YMR123W 369 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 RPS7BYNL096C 573 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 ATX2YOR079C 942 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SAK1YER129W 3429 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YPK1YKL126W 2043 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SHE9YDR393W 1371 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 FLO11YIR019C 4104 nt2.61□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 TIM8YJR135W-A 264 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SHE2YKL130C 741 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SAS2YMR127C 1017 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YNL010WYNL010W 726 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 PET123YOR158W 957 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 IRC16YPR038W 360 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 SGM1YJR134C 2124 nt2.6□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 MMS22YLR320W 4365 nt2.59□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 KIP1YBL063W 3336 nt2.59□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.59□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 BNA7YDR428C 786 nt2.59□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.59□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.59□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.59□□□□□ -1.99
SSP2Q08646 MZM1YDR493W 372 nt2.58□□□□□ -2
SSP2Q08646 RPF1YHR088W 888 nt2.58□□□□□ -2
SSP2Q08646 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.58□□□□□ -2
SSP2Q08646 SLM6YBR266C 453 nt2.58□□□□□ -2
SSP2Q08646 TAE2YPL009C 3117 nt2.57□□□□□ -2
SSP2Q08646 PEX8YGR077C 1770 nt2.57□□□□□ -2
SSP2Q08646 RPI1YIL119C 1224 nt2.57□□□□□ -2
SSP2Q08646 YJL016WYJL016W 1686 nt2.57□□□□□ -2
SSP2Q08646 UFD4YKL010C 4452 nt2.56□□□□□ -2
SSP2Q08646 TUS1YLR425W 3924 nt2.56□□□□□ -2
SSP2Q08646 SEN15YMR059W 387 nt2.56□□□□□ -2
SSP2Q08646 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.56□□□□□ -2
SSP2Q08646 PHO2YDL106C 1680 nt2.56□□□□□ -2
SSP2Q08646 NUP82YJL061W 2142 nt2.56□□□□□ -2
SSP2Q08646 SIR3YLR442C 2937 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 YRB1YDR002W 606 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 COX13YGL191W 390 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 PEX4YGR133W 552 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 MPH1YIR002C 2982 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 YJR079WYJR079W 330 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 PAU8YAL068C 363 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 LSM7YNL147W 348 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 PAU20YOL161C 363 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 NAN1YPL126W 2691 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 STH1YIL126W 4080 nt2.55□□□□□ -2
SSP2Q08646 YJL181WYJL181W 1836 nt2.54□□□□□ -2
SSP2Q08646 KOG1YHR186C 4674 nt2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 129.1 ms