Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

Predictions only

Length 3,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 MKT1YNL085W 2493 nt-0.13□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 COX5BYIL111W 456 nt-0.13□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 PEX12YMR026C 1200 nt-0.13□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 DSE2YHR143W 978 nt-0.13□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 ABF2YMR072W 552 nt-0.13□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 TRM82YDR165W 1335 nt-0.13□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YGR026WYGR026W 837 nt-0.14□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 HYR1YIR037W 492 nt-0.14□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YAR075WYAR075W 474 nt-0.14□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 NCA2YPR155C 1851 nt-0.14□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 HAL9YOL089C 3093 nt-0.14□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.14□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 ALY2YJL084C 3141 nt-0.15□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YDR132CYDR132C 1488 nt-0.15□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YML053CYML053C 639 nt-0.15□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 MPT5YGL178W 2580 nt-0.15□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 RPL35BYDL136W 363 nt-0.16□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 RPL35AYDL191W 363 nt-0.16□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 OTU2YHL013C 924 nt-0.16□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YIL141WYIL141W 390 nt-0.16□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 YKL111CYKL111C 336 nt-0.16□□□□□ -2.43
TOM1Q03280 HDA3YPR179C 1968 nt-0.16□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 INP1YMR204C 1263 nt-0.16□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 PRK1YIL095W 2433 nt-0.16□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 RGI2YIL057C 495 nt-0.17□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 SKO1YNL167C 1944 nt-0.17□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 REF2YDR195W 1602 nt-0.17□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 YDL186WYDL186W 834 nt-0.17□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 RAM2YKL019W 951 nt-0.17□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 PDE2YOR360C 1581 nt-0.18□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 BSC2YDR275W 708 nt-0.18□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt-0.18□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.18□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 ATP16YDL004W 483 nt-0.19□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 CTL1YMR180C 963 nt-0.19□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 TEX1YNL253W 1269 nt-0.19□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 RTT101YJL047C 2529 nt-0.19□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 BNA7YDR428C 786 nt-0.19□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 MIC19YFR011C 513 nt-0.19□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 PRM4YPL156C 855 nt-0.19□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 MSA2YKR077W 1092 nt-0.2□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 SNC2YOR327C 348 nt-0.21□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 snR36snR36 182 nt-0.21□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 SPC2YML055W 537 nt-0.21□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 SWF1YDR126W 1011 nt-0.21□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 YPR172WYPR172W 603 nt-0.21□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 NOP12YOL041C 1380 nt-0.22□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 YGL109WYGL109W 324 nt-0.22□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 CIC1YHR052W 1131 nt-0.22□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 YLR379WYLR379W 375 nt-0.22□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 SPT21YMR179W 2277 nt-0.22□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 TIM21YGR033C 720 nt-0.22□□□□□ -2.44
TOM1Q03280 SCW11YGL028C 1629 nt-0.22□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 NIP100YPL174C 2607 nt-0.22□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 VPS55YJR044C 423 nt-0.23□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 COX12YLR038C 252 nt-0.23□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 NDD1YOR372C 1665 nt-0.23□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YDL187CYDL187C 330 nt-0.23□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 SDL1YIL167W 633 nt-0.23□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YOL134CYOL134C 390 nt-0.23□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 ATG5YPL149W 885 nt-0.23□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 NUR1YDL089W 1455 nt-0.24□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 PTP2YOR208W 2253 nt-0.24□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YDR210WYDR210W 228 nt-0.24□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YKR073CYKR073C 321 nt-0.24□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 RRP6YOR001W 2202 nt-0.24□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 PAU8YAL068C 363 nt-0.24□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 PAU20YOL161C 363 nt-0.24□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 PRP5YBR237W 2550 nt-0.24□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 RPL26AYLR344W 384 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YPR063CYPR063C 423 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 CLB4YLR210W 1383 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 AVT2YEL064C 1443 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YDL050CYDL050C 372 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 MED1YPR070W 1701 nt-0.25□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 ECM11YDR446W 909 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 snR37snR37 386 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 ECM18YDR125C 1362 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 RPL1BYGL135W 654 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YOR169CYOR169C 465 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 RPL1AYPL220W 654 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 DIG2YDR480W 972 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 COQ10YOL008W 624 nt-0.26□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YIR043CYIR043C 693 nt-0.27□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 HHT2YNL031C 411 nt-0.27□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 BAG7YOR134W 1230 nt-0.27□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 MED8YBR193C 672 nt-0.27□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 YKL136WYKL136W 399 nt-0.28□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 WAR1YML076C 2835 nt-0.28□□□□□ -2.45
TOM1Q03280 MUD2YKL074C 1584 nt-0.29□□□□□ -2.46
TOM1Q03280 HMI1YOL095C 2121 nt-0.29□□□□□ -2.46
TOM1Q03280 YFR054CYFR054C 579 nt-0.29□□□□□ -2.46
TOM1Q03280 ROX1YPR065W 1107 nt-0.29□□□□□ -2.46
TOM1Q03280 YGR015CYGR015C 987 nt-0.3□□□□□ -2.46
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