Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CENPEQ02224 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CENPEQ02224 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms