Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 RPL35AYDL191W 363 nt3.03□□□□□ -1.92
YKR011CQ02209 YER121WYER121W 345 nt3.03□□□□□ -1.92
YKR011CQ02209 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt3.03□□□□□ -1.92
YKR011CQ02209 HSK3YKL138C-A 210 nt3.03□□□□□ -1.92
YKR011CQ02209 RPL8BYLL045C 771 nt3.03□□□□□ -1.92
YKR011CQ02209 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt3.03□□□□□ -1.92
YKR011CQ02209 SMC2YFR031C 3513 nt3.03□□□□□ -1.92
YKR011CQ02209 YAT2YER024W 2772 nt3.02□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 TCP1YDR212W 1680 nt3.02□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YER189WYER189W 369 nt3.02□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 RAM2YKL019W 951 nt3.02□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 RPS21AYKR057W 264 nt3.02□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 NPR3YHL023C 3441 nt3.02□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 PSK2YOL045W 3306 nt3.01□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 TRM2YKR056W 1920 nt3.01□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YHR080CYHR080C 4038 nt3.01□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 GOT1YMR292W 417 nt3.01□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 HCH1YNL281W 462 nt3.01□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 CSR2YPR030W 3366 nt3.01□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 VTC4YJL012C 2166 nt3□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 CIN8YEL061C 3003 nt3□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 DRS2YAL026C 4068 nt3□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt3□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YMR324CYMR324C 243 nt3□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 RPL25YOL127W 429 nt3□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 ITC1YGL133W 3795 nt3□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 SOK1YDR006C 2706 nt3□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 ASG1YIL130W 2895 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 SHQ1YIL104C 1524 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 OSH6YKR003W 1347 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 LYS9YNR050C 1341 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 CSN9YDR179C 489 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 USE1YGL098W 738 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YGL239CYGL239C 315 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 BLI1YKL061W 342 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 LRG1YDL240W 3054 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 PUF4YGL014W 2667 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 ATG26YLR189C 3597 nt2.99□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 PEX1YKL197C 3132 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 JIP5YPR169W 1479 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 ENA5YDR038C 3276 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 ENA2YDR039C 3276 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 ENA1YDR040C 3276 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 AI2Q0055 2565 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YDR193WYDR193W 399 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 TIM13YGR181W 318 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 FLO9YAL063C 3969 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 AKR1YDR264C 2295 nt2.98□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 POL2YNL262W 6669 nt2.97□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 GLC3YEL011W 2115 nt2.97□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.97□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 RPL32YBL092W 393 nt2.97□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 YPR099CYPR099C 357 nt2.97□□□□□ -1.93
YKR011CQ02209 PUF6YDR496C 1971 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YSP2YDR326C 4317 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 HTL1YCR020W-B 237 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 snR80snR80 171 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YDR344CYDR344C 444 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 PAC1YOR269W 1485 nt2.96□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 RIF1YBR275C 5751 nt2.95□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.95□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YGR069WYGR069W 336 nt2.95□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 LSO2YGR169C-A 279 nt2.95□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 BAS1YKR099W 2436 nt2.95□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 GIN4YDR507C 3429 nt2.94□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 HTB2YBL002W 396 nt2.94□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.94□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YNL010WYNL010W 726 nt2.94□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YBR197CYBR197C 654 nt2.94□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 GCD6YDR211W 2139 nt2.93□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 PSY2YNL201C 2577 nt2.93□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 KAR3YPR141C 2190 nt2.93□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YDL211CYDL211C 1119 nt2.93□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.93□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 FMP32YFL046W 624 nt2.93□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.93□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YAK1YJL141C 2424 nt2.93□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 SQS1YNL224C 2304 nt2.92□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 YDR048CYDR048C 315 nt2.92□□□□□ -1.94
YKR011CQ02209 QCR7YDR529C 384 nt2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 82.2 ms