Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPCQ01831 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XPCQ01831 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
XPCQ01831 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XPCQ01831 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XPCQ01831 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPCQ01831 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPCQ01831 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPCQ01831 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPCQ01831 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
XPCQ01831 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XPCQ01831 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XPCQ01831 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPCQ01831 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPCQ01831 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XPCQ01831 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XPCQ01831 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XPCQ01831 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XPCQ01831 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
XPCQ01831 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPCQ01831 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XPCQ01831 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms