Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1DQ01668 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms