Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HBBP68871 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HBBP68871 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HBBP68871 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HBBP68871 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HBBP68871 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HBBP68871 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HBBP68871 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms