Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE2MP61081 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE2MP61081 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms