Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFDNP55196 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AFDNP55196 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AFDNP55196 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFDNP55196 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFDNP55196 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFDNP55196 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFDNP55196 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFDNP55196 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFDNP55196 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFDNP55196 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFDNP55196 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
AFDNP55196 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFDNP55196 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFDNP55196 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms