Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHBP55084 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHBP55084 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HADHBP55084 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HADHBP55084 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HADHBP55084 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HADHBP55084 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HADHBP55084 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms