Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE6CP51160 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE6CP51160 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms