Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CAPZBP47756 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CAPZBP47756 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms