Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DCCP43146 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCCP43146 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DCCP43146 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DCCP43146 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCCP43146 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCCP43146 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DCCP43146 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCCP43146 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCCP43146 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCCP43146 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCCP43146 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCCP43146 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DCCP43146 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DCCP43146 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DCCP43146 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DCCP43146 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DCCP43146 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
DCCP43146 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DCCP43146 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCCP43146 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCCP43146 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCCP43146 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCCP43146 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCCP43146 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCCP43146 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCCP43146 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DCCP43146 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DCCP43146 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DCCP43146 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DCCP43146 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCCP43146 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCCP43146 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCCP43146 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCCP43146 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCCP43146 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DCCP43146 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCCP43146 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCCP43146 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCCP43146 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCCP43146 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DCCP43146 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DCCP43146 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DCCP43146 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DCCP43146 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms