Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC1A1P43005 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A1P43005 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A1P43005 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A1P43005 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC1A1P43005 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms