Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTHFRP42898 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms