Protein–RNA interactions for Protein: P36070

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, yeastyeast

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3P36070 RPC10YHR143W-A 213 nt2.55□□□□□ -2
RRN3P36070 YLR031WYLR031W 561 nt2.55□□□□□ -2
RRN3P36070 RPS17AYML024W 411 nt2.55□□□□□ -2
RRN3P36070 YML108WYML108W 318 nt2.55□□□□□ -2
RRN3P36070 NAN1YPL126W 2691 nt2.55□□□□□ -2
RRN3P36070 MPH1YIR002C 2982 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 SEC26YDR238C 2922 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 ARP8YOR141C 2646 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 YNL010WYNL010W 726 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 YOR055WYOR055W 435 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 ATP3YBR039W 936 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 RSA1YPL193W 1146 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 YPL205CYPL205C 345 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 VPS64YDR200C 1815 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 GIN4YDR507C 3429 nt2.54□□□□□ -2
RRN3P36070 YJL016WYJL016W 1686 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 RRP6YOR001W 2202 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 YHR125WYHR125W 306 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 NCE101YJL205C 162 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 BET3YKR068C 582 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 AIM29YKR074W 468 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 IRC19YLL033W 693 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 YPL276WYPL276W 438 nt2.53□□□□□ -2
RRN3P36070 AFI1YOR129C 2682 nt2.53□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YEF3YLR249W 3135 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN3P36070 TAE2YPL009C 3117 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN3P36070 KTI11YBL071W-A 249 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YOR248WYOR248W 303 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN3P36070 IPT1YDR072C 1584 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN3P36070 MUD2YKL074C 1584 nt2.52□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YKR078WYKR078W 1758 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 BNI1YNL271C 5862 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 RNH70YGR276C 1662 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 TOM22YNL131W 459 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 ROX1YPR065W 1107 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 snR41snR41 95 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 snR54snR54 86 nt2.51□□□□□ -2.01
RRN3P36070 RPO41YFL036W 4056 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 RSE1YML049C 4086 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YAR068WYAR068W 486 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YER138CYER138C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YER160CYER160C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YJR027WYJR027W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YML039WYML039W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YML045WYML045W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YMR050CYMR050C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.5□□□□□ -2.01
RRN3P36070 USO1YDL058W 5373 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 CLN3YAL040C 1743 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 VOA1YGR106C 798 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 AYR1YIL124W 894 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 GRX8YLR364W 330 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 SAS2YMR127C 1017 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 COX7YMR256C 183 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 TUS1YLR425W 3924 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 PPN1YDR452W 2025 nt2.49□□□□□ -2.01
RRN3P36070 MMS22YLR320W 4365 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YPR097WYPR097W 3222 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 CDC50YCR094W 1176 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 VAR1Q0140 1197 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YLR269CYLR269C 351 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 VTI1YMR197C 654 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YOR050CYOR050C 348 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 MLH1YMR167W 2310 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 VPS52YDR484W 1926 nt2.48□□□□□ -2.01
RRN3P36070 STE11YLR362W 2154 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN3P36070 ATP17YDR377W 306 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN3P36070 NOP10YHR072W-A 177 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN3P36070 NBL1YHR199C-A 222 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN3P36070 MSL1YIR009W 336 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN3P36070 TEN1YLR010C 483 nt2.47□□□□□ -2.01
RRN3P36070 YPR039WYPR039W 336 nt2.47□□□□□ -2.01
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