Protein–RNA interactions for Protein: P32487

LYP1, Lysine-specific permease, yeast

Predictions only

Length 611 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYP1	P32487	RDS1	YCR106W	2499 nt		3.31	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.31	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.31	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YGL149W	YGL149W	306 nt		3.3	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YJL020W-A	YJL020W-A	258 nt		3.3	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	HSK3	YKL138C-A	210 nt		3.3	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YKL183C-A	YKL183C-A	213 nt		3.3	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	TAR1	YLR154W-C	375 nt		3.3	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	SGO1	YOR073W	1773 nt		3.3	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	SOK1	YDR006C	2706 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	SPT10	YJL127C	1923 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	AIM9	YER080W	1884 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	ASG1	YIL130W	2895 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	ANB1	YJR047C	474 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	SHH3	YMR118C	591 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	PUF4	YGL014W	2667 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	OSW7	YFR039C	1533 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	URA2	YJL130C	6645 nt		3.29	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	PSK2	YOL045W	3306 nt		3.28	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	MTC3	YGL226W	372 nt		3.28	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YGR265W	YGR265W	411 nt		3.28	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		3.28	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	RPL25	YOL127W	429 nt		3.28	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YOR072W-A	YOR072W-A	249 nt		3.28	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	YOR225W	YOR225W	330 nt		3.28	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	ITC1	YGL133W	3795 nt		3.28	□□□□□ -1.88
LYP1	P32487	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.27	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	PAU10	YDR542W	363 nt		3.27	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	PAU11	YGL261C	363 nt		3.27	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	PAU4	YLR461W	363 nt		3.27	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YOP1	YPR028W	543 nt		3.27	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	GIS4	YML006C	2325 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	RPL35A	YDL191W	363 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	CYC7	YEL039C	342 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YGL239C	YGL239C	315 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YMR324C	YMR324C	243 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	HCH1	YNL281W	462 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YBR137W	YBR137W	540 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	AI2	Q0055	2565 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	DUF1	YOL087C	3351 nt		3.26	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	PUF6	YDR496C	1971 nt		3.25	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	TIM13	YGR181W	318 nt		3.25	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	RPS8A	YBL072C	603 nt		3.25	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		3.25	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	TRS120	YDR407C	3870 nt		3.24	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	DAN4	YJR151C	3486 nt		3.24	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	VTC4	YJL012C	2166 nt		3.24	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.24	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YNL010W	YNL010W	726 nt		3.24	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YBR197C	YBR197C	654 nt		3.24	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	BAS1	YKR099W	2436 nt		3.24	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YPR022C	YPR022C	3402 nt		3.24	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	JIP5	YPR169W	1479 nt		3.23	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	PSY2	YNL201C	2577 nt		3.23	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	GIN4	YDR507C	3429 nt		3.23	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.22	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.22	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	CSN9	YDR179C	489 nt		3.22	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.22	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.22	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	YBR121C-A	YBR121C-A	159 nt		3.22	□□□□□ -1.89
LYP1	P32487	DSE4	YNR067C	3354 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	NUP120	YKL057C	3114 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	Q0032	Q0032	291 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	snR76	snR76	109 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	USE1	YGL098W	738 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	LSO2	YGR169C-A	279 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	TMA19	YKL056C	504 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	RPL32	YBL092W	393 nt		3.21	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	LYS9	YNR050C	1341 nt		3.2	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	HTL1	YCR020W-B	237 nt		3.2	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	FAP7	YDL166C	594 nt		3.2	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	BLI1	YKL061W	342 nt		3.2	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	RGM1	YMR182C	636 nt		3.2	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	PAC1	YOR269W	1485 nt		3.2	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	GCD6	YDR211W	2139 nt		3.2	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	SLA1	YBL007C	3735 nt		3.2	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	DIS3	YOL021C	3006 nt		3.19	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	KAR3	YPR141C	2190 nt		3.19	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	PSK1	YAL017W	4071 nt		3.19	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.19	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	STT4	YLR305C	5703 nt		3.19	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	SAK1	YER129W	3429 nt		3.19	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YDR344C	YDR344C	444 nt		3.19	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YJL070C	YJL070C	2667 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	IPT1	YDR072C	1584 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	QCR7	YDR529C	384 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YGL024W	YGL024W	336 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	HTB2	YBL002W	396 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	CDC20	YGL116W	1833 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	RCY1	YJL204C	2523 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	OSH6	YKR003W	1347 nt		3.18	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	ORC1	YML065W	2745 nt		3.17	□□□□□ -1.9

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