Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL4A5P29400 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
COL4A5P29400 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms