Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKBIAP25963 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms