Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NR2F2P24468 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR2F2P24468 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms