Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFE3P19532 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFE3P19532 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFE3P19532 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TFE3P19532 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TFE3P19532 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TFE3P19532 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFE3P19532 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFE3P19532 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms