Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTPS1P17812 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTPS1P17812 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms