Protein–RNA interactions for Protein: P13712

MSI1, Chromatin assembly factor 1 subunit p50, yeastyeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSI1P13712 MLH1YMR167W 2310 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 BAS1YKR099W 2436 nt2.07□□□□□ -2.08
MSI1P13712 PHO2YDL106C 1680 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 SAK1YER129W 3429 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 SDC25YLL016W 3147 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 GET1YGL020C 708 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 RNP1YLL046C 750 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YLR269CYLR269C 351 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YNL324WYNL324W 396 nt2.06□□□□□ -2.08
MSI1P13712 RPC10YHR143W-A 213 nt2.05□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.05□□□□□ -2.08
MSI1P13712 NUP170YBL079W 4509 nt2.05□□□□□ -2.08
MSI1P13712 SSY1YDR160W 2559 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 RRP12YPL012W 3687 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YCR064CYCR064C 411 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 AAD16YFL057C 459 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YHR125WYHR125W 306 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 RAM2YKL019W 951 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YKL111CYKL111C 336 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 CCW14YLR390W-A 717 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 SAS2YMR127C 1017 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 PHO91YNR013C 2685 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YOR105WYOR105W 327 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 SVL3YPL032C 2478 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 BRO1YPL084W 2535 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YPR089WYPR089W 2667 nt2.04□□□□□ -2.08
MSI1P13712 RNH70YGR276C 1662 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 AMS1YGL156W 3252 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YGR050CYGR050C 357 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 PAU14YIL176C 363 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YJL202CYJL202C 348 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 PAU1YJL223C 363 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YLR031WYLR031W 561 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YLR458WYLR458W 381 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 SIP18YMR175W 240 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 ICY1YMR195W 384 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 YOR248WYOR248W 303 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 PRM3YPL192C 402 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 MGR1YCL044C 1254 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 snR54snR54 86 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 SWA2YDR320C 2007 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 PPN1YDR452W 2025 nt2.03□□□□□ -2.08
MSI1P13712 PRP6YBR055C 2700 nt2.03□□□□□ -2.09
MSI1P13712 OSW7YFR039C 1533 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 TMN3YER113C 2121 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 MSB1YOR188W 3414 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YPK1YKL126W 2043 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 RPL40AYIL148W 387 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 TEN1YLR010C 483 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YLR101CYLR101C 396 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 TIF11YMR260C 462 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 CRS5YOR031W 210 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 HRD3YLR207W 2502 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 RGA2YDR379W 3030 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 KSP1YHR082C 3090 nt2.02□□□□□ -2.09
MSI1P13712 PES4YFR023W 1836 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YJL181WYJL181W 1836 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 HUR1YGL168W 333 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 ACB1YGR037C 264 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 AYR1YIL124W 894 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 PET191YJR034W 327 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 PSY1YKL076C 384 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 IRC19YLL033W 693 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 CMC2YBL059C-A 330 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 SCP160YJL080C 3669 nt2.01□□□□□ -2.09
MSI1P13712 NUP82YJL061W 2142 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 HOS4YIL112W 3252 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YRB1YDR002W 606 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YER188C-AYER188C-A 300 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 NBL1YHR199C-A 222 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 NCE101YJL205C 162 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 AIM32YML050W 936 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 SEN15YMR059W 387 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 IGO1YNL157W 507 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 CDC33YOL139C 642 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 SLM6YBR266C 453 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 INP51YIL002C 2841 nt2□□□□□ -2.09
MSI1P13712 SCD5YOR329C 2619 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YDL068WYDL068W 330 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YDR114CYDR114C 303 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YKL063CYKL063C 504 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 COX7YMR256C 183 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 TSC3YBR058C-A 243 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 MSS18YPR134W 807 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YOL098CYOL098C 3114 nt1.99□□□□□ -2.09
MSI1P13712 PEX4YGR133W 552 nt1.98□□□□□ -2.09
MSI1P13712 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.98□□□□□ -2.09
MSI1P13712 CRG1YHR209W 876 nt1.98□□□□□ -2.09
MSI1P13712 LSM7YNL147W 348 nt1.98□□□□□ -2.09
MSI1P13712 FYV12YOR183W 390 nt1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms