Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRCP08575 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRCP08575 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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