Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms