Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EGFRP00533 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EGFRP00533 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EGFRP00533 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFRP00533 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFRP00533 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFRP00533 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFRP00533 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFRP00533 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFRP00533 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFRP00533 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFRP00533 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFRP00533 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EGFRP00533 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EGFRP00533 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EGFRP00533 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EGFRP00533 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
EGFRP00533 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms