Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPM2O94759 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRPM2O94759 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms