Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSO75390 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSO75390 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSO75390 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSO75390 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSO75390 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSO75390 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSO75390 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSO75390 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CSO75390 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CSO75390 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CSO75390 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CSO75390 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms