Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
N4BP1O75113 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
N4BP1O75113 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms