Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSCO60682 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSCO60682 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSCO60682 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSCO60682 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSCO60682 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSCO60682 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms