Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUBNO60494 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUBNO60494 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUBNO60494 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUBNO60494 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CUBNO60494 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUBNO60494 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CUBNO60494 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CUBNO60494 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CUBNO60494 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CUBNO60494 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms