Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CXCL13O43927 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL13O43927 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms