Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VEGFDO43915 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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VEGFDO43915 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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VEGFDO43915 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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VEGFDO43915 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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VEGFDO43915 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VEGFDO43915 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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