Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP9BO43861 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP9BO43861 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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