Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYTH3O43739 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYTH3O43739 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYTH3O43739 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms