Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACTN4O43707 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms