Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP290O15078 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP290O15078 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP290O15078 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP290O15078 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP290O15078 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP290O15078 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP290O15078 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP290O15078 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP290O15078 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP290O15078 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP290O15078 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
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