Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 VEZT-218ENST00000548822 595 ntTSL 412.49□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 34.7
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DDX3XO00571 VEZT-221ENST00000549192 2629 ntTSL 211.34□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-212ENST00000547611 1224 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.617e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-222ENST00000549589 571 ntTSL 411.12□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-225ENST00000550803 648 ntTSL 311.12□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-211ENST00000547484 526 ntTSL 410.51□□□□□ -0.737e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 SUMO2-201ENST00000314523 809 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.737e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-214ENST00000547997 3002 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-209ENST00000546557 1068 ntTSL 510.13□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 SUMO2-202ENST00000420826 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.797e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-229ENST00000551472 608 ntTSL 49.99□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-237ENST00000552626 880 ntTSL 49.95□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-213ENST00000526133 367 ntTSL 29.9□□□□□ -0.827e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-220ENST00000549002 566 ntTSL 29.49□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-215ENST00000548245 588 ntTSL 39.29□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 39.05□□□□□ -0.967e-28■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-232ENST00000551792 577 ntTSL 28.96□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-223ENST00000549624 542 ntTSL 48.96□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-235ENST00000552031 540 ntTSL 48.96□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-206ENST00000546398 2075 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.997e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 48.65□□□□□ -1.027e-28■■■■■ 34.7
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DDX3XO00571 VEZT-226ENST00000551039 564 ntTSL 46.93□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-234ENST00000551994 2362 ntTSL 26.43□□□□□ -1.387e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-241ENST00000553063 591 ntTSL 45.64□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-239ENST00000552821 482 ntTSL 55.61□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-238ENST00000552660 2712 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.587e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 VEZT-216ENST00000548371 999 ntTSL 34.71□□□□□ -1.667e-7■■■■■ 34.7
DDX3XO00571 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.73e-8■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 SEC22C-216ENST00000493107 827 ntTSL 510.13□□□□□ -0.793e-11■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.839e-12■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.351e-8■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 LRIG1-209ENST00000498287 689 ntTSL 417.49■□□□□ 0.391e-8■■■■■ 34.6
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DDX3XO00571 GLB1-206ENST00000438227 569 ntTSL 46.43□□□□□ -1.383e-9■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 PYCR1-213ENST00000584848 949 ntTSL 515.26■□□□□ 0.039e-26■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-10■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.613e-10■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-8■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 ZDHHC6-205ENST00000626395 2906 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 34.6
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DDX3XO00571 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.765e-8■■■■■ 34.6
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DDX3XO00571 ZSCAN16-AS1-202ENST00000602810 1536 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 34.6
DDX3XO00571 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 BOD1-205ENST00000477985 850 ntTSL 213.18□□□□□ -0.31e-23■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 KATNB1-203ENST00000562592 853 ntTSL 316.29■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 KATNB1-207ENST00000566726 728 ntTSL 314.42□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 SPPL2A-203ENST00000558414 564 ntTSL 45.85□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.15e-19■■■■■ 34.5
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DDX3XO00571 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.92e-17■■■■■ 34.5
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DDX3XO00571 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.645e-7■■■■■ 34.5
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DDX3XO00571 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.423e-18■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.395e-13■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-247ENST00000555733 924 ntTSL 523.7■■□□□ 1.385e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FAM47E-STBD1-201ENST00000509377 1484 ntTSL 223.57■■□□□ 1.365e-7■■■■■ 34.5
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DDX3XO00571 DHX32-203ENST00000415732 803 ntTSL 322.73■■□□□ 1.235e-7■■■■■ 34.5
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DDX3XO00571 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PLEKHA3-203ENST00000453653 749 ntTSL 321.61■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TWF1-202ENST00000546506 582 ntTSL 321.06■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-211ENST00000528580 488 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-216ENST00000529842 696 ntTSL 420.1■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 IAH1-204ENST00000481688 1011 ntTSL 519.98■□□□□ 0.795e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-202ENST00000313059 1090 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 RAB40C-207ENST00000563109 710 ntTSL 319.76■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-219ENST00000531707 500 ntTSL 419.75■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-204ENST00000525486 564 ntTSL 419.75■□□□□ 0.755e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 FXYD1-210ENST00000592818 959 ntTSL 519.68■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-217ENST00000530478 588 ntTSL 419.64■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-238ENST00000554833 571 ntTSL 419.47■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-239ENST00000554893 578 ntTSL 419.47■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 PARP10-220ENST00000532311 481 ntTSL 419.36■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 34.5
DDX3XO00571 NDRG2-243ENST00000555384 775 ntTSL 519.13■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 34.5
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