Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TULP1O00294 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TULP1O00294 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TULP1O00294 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TULP1O00294 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TULP1O00294 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TULP1O00294 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TULP1O00294 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms