Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFKBIEO00221 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms