Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOTOA8MTQ0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NOTOA8MTQ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms