Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms