Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C5orf49A4QMS7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C5orf49A4QMS7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms