Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF22A3QJZ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms