Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POTEB3A0JP26 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEB3A0JP26 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms